Protein–RNA interactions for Protein: Q8N878

FRMD1, FERM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1Q8N878 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD1Q8N878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD1Q8N878 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMD1Q8N878 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD1Q8N878 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD1Q8N878 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.8 ms