Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms