Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
ARHGEF28Q8N1W1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF28Q8N1W1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF28Q8N1W1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF28Q8N1W1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF28Q8N1W1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
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