Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM48Q8IWZ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM48Q8IWZ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM48Q8IWZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM48Q8IWZ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms