Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
APLFQ8IW19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APLFQ8IW19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms