Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KSR1Q8IVT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KSR1Q8IVT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KSR1Q8IVT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KSR1Q8IVT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KSR1Q8IVT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KSR1Q8IVT5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms