Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW0

SESTD1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESTD1Q86VW0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SESTD1Q86VW0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SESTD1Q86VW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SESTD1Q86VW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SESTD1Q86VW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SESTD1Q86VW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms