Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP1Q7Z6B7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRGAP1Q7Z6B7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP1Q7Z6B7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRGAP1Q7Z6B7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms