Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRAMD4Q6IC98 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD4Q6IC98 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD4Q6IC98 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms