Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLFN13Q68D06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SLFN13Q68D06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN13Q68D06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN13Q68D06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms