Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPD7Q5XG87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAPD7Q5XG87 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPD7Q5XG87 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPD7Q5XG87 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPD7Q5XG87 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms