Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSF3Q4G176 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSF3Q4G176 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSF3Q4G176 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSF3Q4G176 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms