Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT71Q3SY84 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT71Q3SY84 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT71Q3SY84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT71Q3SY84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT71Q3SY84 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms