Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD55Q3KP44 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD55Q3KP44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD55Q3KP44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD55Q3KP44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms