Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SWI5Q1ZZU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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