Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA9Q16795 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDUFA9Q16795 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFA9Q16795 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFA9Q16795 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms