Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PRR4Q16378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PRR4Q16378 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PRR4Q16378 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRR4Q16378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PRR4Q16378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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PRR4Q16378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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PRR4Q16378 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PRR4Q16378 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRR4Q16378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRR4Q16378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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PRR4Q16378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRR4Q16378 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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