Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1EQ15878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1EQ15878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1EQ15878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms