Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA2Q15560 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA2Q15560 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TCEA2Q15560 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCEA2Q15560 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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