Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SF3B3Q15393 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SF3B3Q15393 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SF3B3Q15393 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SF3B3Q15393 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SF3B3Q15393 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
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