Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CDK13Q14004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CDK13Q14004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CDK13Q14004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.06■■■■■ 4
CDK13Q14004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CDK13Q14004 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CDK13Q14004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CDK13Q14004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CDK13Q14004 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
CDK13Q14004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CDK13Q14004 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CDK13Q14004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CDK13Q14004 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CDK13Q14004 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CDK13Q14004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CDK13Q14004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CDK13Q14004 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CDK13Q14004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CDK13Q14004 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CDK13Q14004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CDK13Q14004 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK13Q14004 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
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