Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA7Q13683 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA7Q13683 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGA7Q13683 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA7Q13683 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms