Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ITGA7Q13683 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ITGA7Q13683 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGA7Q13683 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ITGA7Q13683 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ITGA7Q13683 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITGA7Q13683 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ITGA7Q13683 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGA7Q13683 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ITGA7Q13683 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGA7Q13683 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGA7Q13683 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGA7Q13683 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGA7Q13683 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGA7Q13683 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITGA7Q13683 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ITGA7Q13683 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGA7Q13683 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ITGA7Q13683 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGA7Q13683 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITGA7Q13683 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGA7Q13683 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGA7Q13683 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGA7Q13683 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGA7Q13683 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGA7Q13683 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGA7Q13683 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGA7Q13683 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGA7Q13683 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGA7Q13683 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGA7Q13683 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGA7Q13683 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ITGA7Q13683 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGA7Q13683 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGA7Q13683 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGA7Q13683 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGA7Q13683 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGA7Q13683 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGA7Q13683 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGA7Q13683 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGA7Q13683 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGA7Q13683 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGA7Q13683 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGA7Q13683 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGA7Q13683 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ITGA7Q13683 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGA7Q13683 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGA7Q13683 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGA7Q13683 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGA7Q13683 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGA7Q13683 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGA7Q13683 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA7Q13683 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGA7Q13683 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGA7Q13683 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGA7Q13683 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGA7Q13683 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGA7Q13683 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGA7Q13683 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGA7Q13683 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGA7Q13683 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGA7Q13683 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGA7Q13683 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGA7Q13683 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGA7Q13683 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGA7Q13683 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGA7Q13683 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGA7Q13683 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA7Q13683 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ITGA7Q13683 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA7Q13683 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGA7Q13683 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGA7Q13683 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGA7Q13683 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGA7Q13683 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGA7Q13683 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGA7Q13683 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGA7Q13683 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGA7Q13683 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGA7Q13683 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA7Q13683 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGA7Q13683 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGA7Q13683 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGA7Q13683 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGA7Q13683 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA7Q13683 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGA7Q13683 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGA7Q13683 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGA7Q13683 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGA7Q13683 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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