Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3FQ13275 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3FQ13275 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3FQ13275 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3FQ13275 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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