Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms