Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPRL3Q12980 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPRL3Q12980 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPRL3Q12980 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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