Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD51Q06609 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51Q06609 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD51Q06609 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD51Q06609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51Q06609 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms