Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNFAIP2Q03169 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFAIP2Q03169 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFAIP2Q03169 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms