Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2BP67870 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2BP67870 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2BP67870 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms