Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RACK1P63244 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RACK1P63244 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RACK1P63244 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RACK1P63244 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RACK1P63244 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RACK1P63244 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RACK1P63244 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RACK1P63244 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RACK1P63244 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RACK1P63244 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RACK1P63244 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RACK1P63244 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RACK1P63244 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RACK1P63244 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RACK1P63244 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RACK1P63244 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RACK1P63244 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RACK1P63244 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RACK1P63244 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RACK1P63244 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RACK1P63244 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RACK1P63244 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RACK1P63244 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RACK1P63244 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RACK1P63244 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RACK1P63244 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RACK1P63244 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RACK1P63244 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RACK1P63244 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RACK1P63244 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RACK1P63244 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RACK1P63244 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RACK1P63244 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RACK1P63244 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RACK1P63244 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RACK1P63244 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RACK1P63244 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RACK1P63244 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RACK1P63244 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RACK1P63244 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RACK1P63244 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RACK1P63244 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RACK1P63244 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RACK1P63244 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RACK1P63244 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RACK1P63244 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RACK1P63244 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RACK1P63244 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RACK1P63244 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RACK1P63244 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RACK1P63244 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RACK1P63244 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RACK1P63244 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RACK1P63244 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RACK1P63244 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RACK1P63244 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RACK1P63244 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RACK1P63244 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RACK1P63244 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RACK1P63244 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RACK1P63244 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RACK1P63244 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RACK1P63244 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms