Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP1S1P61966 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1S1P61966 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1S1P61966 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S1P61966 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S1P61966 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms