Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR4P61073 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR4P61073 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR4P61073 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR4P61073 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms