Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.51■■■□□ 2
AP3M2P53677 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
AP3M2P53677 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3M2P53677 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M2P53677 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3M2P53677 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms