Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4BP51164 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP4BP51164 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP4BP51164 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4BP51164 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4BP51164 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms