Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSNK1EP49674 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK1EP49674 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1EP49674 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1EP49674 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms