Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYB561P49447 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYB561P49447 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYB561P49447 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYB561P49447 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYB561P49447 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYB561P49447 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYB561P49447 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYB561P49447 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYB561P49447 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYB561P49447 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYB561P49447 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYB561P49447 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYB561P49447 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CYB561P49447 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CYB561P49447 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYB561P49447 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYB561P49447 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYB561P49447 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYB561P49447 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYB561P49447 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYB561P49447 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYB561P49447 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYB561P49447 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYB561P49447 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYB561P49447 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYB561P49447 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYB561P49447 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYB561P49447 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYB561P49447 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYB561P49447 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYB561P49447 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYB561P49447 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYB561P49447 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYB561P49447 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYB561P49447 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYB561P49447 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYB561P49447 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYB561P49447 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYB561P49447 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYB561P49447 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYB561P49447 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYB561P49447 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYB561P49447 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYB561P49447 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYB561P49447 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYB561P49447 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYB561P49447 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYB561P49447 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYB561P49447 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYB561P49447 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYB561P49447 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYB561P49447 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYB561P49447 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYB561P49447 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.9 ms