Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SLC4A3P48751 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A3P48751 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC4A3P48751 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC4A3P48751 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms