Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOLR3P41439 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR3P41439 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR3P41439 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR3P41439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOLR3P41439 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOLR3P41439 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOLR3P41439 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOLR3P41439 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms