Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX3P40426 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX3P40426 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBX3P40426 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX3P40426 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX3P40426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBX3P40426 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX3P40426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX3P40426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX3P40426 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBX3P40426 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX3P40426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX3P40426 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX3P40426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX3P40426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBX3P40426 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX3P40426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX3P40426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PBX3P40426 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX3P40426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX3P40426 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX3P40426 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX3P40426 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PBX3P40426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX3P40426 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX3P40426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX3P40426 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX3P40426 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PBX3P40426 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PBX3P40426 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX3P40426 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX3P40426 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX3P40426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBX3P40426 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX3P40426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX3P40426 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX3P40426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBX3P40426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBX3P40426 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBX3P40426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBX3P40426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX3P40426 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX3P40426 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX3P40426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PBX3P40426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX3P40426 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX3P40426 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX3P40426 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX3P40426 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PBX3P40426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PBX3P40426 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX3P40426 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX3P40426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PBX3P40426 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PBX3P40426 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX3P40426 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX3P40426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PBX3P40426 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PBX3P40426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX3P40426 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX3P40426 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PBX3P40426 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PBX3P40426 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX3P40426 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX3P40426 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms