Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASQ1P31415 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASQ1P31415 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ1P31415 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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