Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SSFA2P28290 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SSFA2P28290 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SSFA2P28290 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SSFA2P28290 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SSFA2P28290 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SSFA2P28290 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms