Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX1P27695 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX1P27695 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX1P27695 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX1P27695 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX1P27695 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX1P27695 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX1P27695 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX1P27695 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX1P27695 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX1P27695 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX1P27695 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX1P27695 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX1P27695 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX1P27695 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX1P27695 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX1P27695 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX1P27695 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX1P27695 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX1P27695 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX1P27695 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX1P27695 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX1P27695 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX1P27695 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX1P27695 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX1P27695 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX1P27695 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX1P27695 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX1P27695 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX1P27695 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX1P27695 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX1P27695 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX1P27695 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX1P27695 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX1P27695 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX1P27695 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX1P27695 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX1P27695 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX1P27695 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX1P27695 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX1P27695 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX1P27695 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX1P27695 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX1P27695 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX1P27695 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX1P27695 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX1P27695 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX1P27695 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX1P27695 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX1P27695 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX1P27695 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX1P27695 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX1P27695 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX1P27695 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX1P27695 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX1P27695 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms