Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P22392 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P22392 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P22392 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P22392 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P22392 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P22392 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P22392 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P22392 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P22392 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P22392 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P22392 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P22392 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P22392 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P22392 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P22392 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P22392 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P22392 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P22392 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P22392 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P22392 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME2P22392 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME2P22392 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME2P22392 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME2P22392 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME2P22392 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P22392 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P22392 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P22392 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P22392 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P22392 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P22392 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P22392 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P22392 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P22392 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P22392 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P22392 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P22392 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P22392 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P22392 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P22392 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P22392 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P22392 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P22392 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME2P22392 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P22392 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P22392 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P22392 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P22392 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P22392 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P22392 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P22392 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P22392 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P22392 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P22392 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME2P22392 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P22392 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P22392 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P22392 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P22392 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P22392 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P22392 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P22392 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME2P22392 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME2P22392 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P22392 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P22392 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P22392 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P22392 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P22392 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P22392 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P22392 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P22392 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME2P22392 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME2P22392 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P22392 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P22392 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P22392 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P22392 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms