Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6AP20340 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6AP20340 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6AP20340 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms