Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN2P17655 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CAPN2P17655 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN2P17655 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN2P17655 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN2P17655 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms