Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF7P17544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7P17544 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7P17544 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7P17544 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7P17544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF7P17544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7P17544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7P17544 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF7P17544 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7P17544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7P17544 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7P17544 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF7P17544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF7P17544 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF7P17544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF7P17544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF7P17544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF7P17544 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF7P17544 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF7P17544 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF7P17544 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF7P17544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF7P17544 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF7P17544 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF7P17544 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF7P17544 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF7P17544 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF7P17544 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF7P17544 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF7P17544 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF7P17544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF7P17544 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATF7P17544 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATF7P17544 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF7P17544 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF7P17544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF7P17544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF7P17544 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF7P17544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF7P17544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF7P17544 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF7P17544 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF7P17544 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF7P17544 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF7P17544 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF7P17544 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF7P17544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF7P17544 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF7P17544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATF7P17544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATF7P17544 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF7P17544 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF7P17544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF7P17544 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF7P17544 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF7P17544 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF7P17544 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms