Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNB3P16520 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNB3P16520 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNB3P16520 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNB3P16520 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNB3P16520 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNB3P16520 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNB3P16520 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNB3P16520 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB3P16520 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB3P16520 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNB3P16520 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB3P16520 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB3P16520 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB3P16520 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB3P16520 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB3P16520 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB3P16520 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB3P16520 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB3P16520 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB3P16520 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB3P16520 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB3P16520 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB3P16520 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB3P16520 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB3P16520 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB3P16520 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB3P16520 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GNB3P16520 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNB3P16520 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNB3P16520 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNB3P16520 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNB3P16520 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNB3P16520 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB3P16520 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB3P16520 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB3P16520 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB3P16520 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB3P16520 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB3P16520 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB3P16520 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB3P16520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB3P16520 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB3P16520 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB3P16520 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB3P16520 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNB3P16520 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB3P16520 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB3P16520 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB3P16520 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB3P16520 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB3P16520 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB3P16520 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNB3P16520 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNB3P16520 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNB3P16520 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms