Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXD8P13378 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXD8P13378 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXD8P13378 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD8P13378 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HOXD8P13378 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.4 ms