Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3L1P0CL83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3L1P0CL83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3L1P0CL83 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG3L1P0CL83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms