Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M6

IQCF3, IQ domain-containing protein F3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF3P0C7M6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IQCF3P0C7M6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IQCF3P0C7M6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCF3P0C7M6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms