Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXB7P09629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXB7P09629 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXB7P09629 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HOXB7P09629 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms